反滲透膜的化學清洗是反滲透裝置運行維護中的一個重要環節，它直接影響著反滲透膜的使用性能和使用壽命在系統的運行中，盡管選擇了適宜的操作條件，但隨著運行時間的增加，膜組內的微生物、有機物和無機雜質顆粒會不可避免的污堵膜表面，使反滲透膜發生污堵，造成系統產水量下降及脫鹽率下降等情況。因此須采取的清洗方法，以除去膜面及膜孔內的污染物，達到恢復透水量、延長膜使用壽命的目的。
當反滲透系統(或裝置)出現以下癥狀時，需要進行化學清洗或物理沖洗：
(1)在正常給水壓力下，產水量較正常值下降10 %~15 %；
(2)為維持正常的產水量，經溫度校正后的給水壓力增加10 %~15 %；產水水質降低10 %~15 %，透鹽率增加10 %~15 %；給水壓力增加10 %~15 %；
(3)系統各段之間壓差快速明顯的增加。
膜的清洗方法可分為二類：物理、化學。
1、物理法
物理清洗是用機械方法從膜面上脫除污染物，這些方法包括：正方向沖洗法、變方向沖洗法、反壓沖洗法、振動清洗法、排氣沖水法、空氣噴射法、二氧化碳清洗法和自動海綿球清洗法等，其中變方向沖洗法是物理清洗法中醉為有校的清洗方法。
2、化學法
化學清洗通常使用化學清洗劑進行清洗，如稀酸、稀堿、酶、表面活性劑、結合劑等。酸類清洗劑，可以溶解除去礦物質及DNA。檸檬酸、EDTA之類化學劑可用于除垢和堿性污染物。Biz、Uitrasol 之類去垢劑可有校除去生物污染。
有時針對某種污染物或污染狀況，要使用RO 藥劑制造商的化學清洗藥劑，并且在應用時，要遵循藥劑供應商提供的產品性能及使用說明。特定情況下可針對具體情況，從反滲透裝置取出已發生污染的單支膜元件進行測試和清洗試驗，以確定合適的化學藥劑和清洗方案。使用化學法清洗時，使用的化學藥劑須與膜材料相容，并嚴格按膜生產廠提出的條件(壓力、溫度PH 和流速)進行清洗，防止膜發生不可逆損傷。
3、增加預防性清洗
反滲透膜系統運行一段時間后，會在膜表面形成一些結垢性物質，但沒有達到清洗條件時，膜表面的結垢物質成為晶體生長的晶核，晶體生長速度加快，反滲透的各段壓差增長較快。yu防性清洗可以保持膜表面的清潔度，并降低濃差極化的影響。
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